Авраамиев Богоявленский монастырь - один из древнейших в России. Он был основан в XI веке на восточной окраине Ростова преподобным Авраамием на месте языческого капища, где поклонялись богу Велесу, и стал первым монастырем в Ростовской земле. Как свидетельствует одно из сказаний, во время богослужения из глаз, рта и ушей Белеса вырывались дым, искры и пламя. Языческое божество было сделано полым внутри, и в нем располагалась лестница, ведущая к голове идола. Жрец, стоя на лестнице, сжигал смолистые вещества, что и создавало нужный эффект. Преподобный Авраамий сверг идола и основал монастырь, за что чуть не поплатился жизнью - язычники не раз пытались ограбить и сжечь монастырь Авраамия.
Сам Авраамий происходил из города Чухломы и родился в богатой языческой семье. До 18 лет он страдал тяжелой болезнью и, однажды услышав беседу новгородцев-христиан, гостивших в доме его отца, о Христе, дал тайный обет принять монашество в случае выздоровления. Исцеление совершилось, и Авраамий ушел в Новгород, а затем на Валаам, где и принял монашеский постриг. С Валаама Авраамий пришел в Ростов и поселился на берегу озера. Он разрушал идолов, проповедовал, учил детей грамоте. Почти 30 лет он прожил в основанном им монастыре и после смерти был погребен в монастырском соборе.
Обитель сильно пострадала от нашествия татар и в начале XVII века. В нем бывал в XVI веке царь Иван Грозный, построивший в обители в 1553 году храм Богоявления Господня в честь взятия Казани и вложивший в ризницу монастыря большую водосвятную чашу и несколько икон, а в первой половине XIX века - императрица Мария Федоровна и император Александр I.
Кроме Богоявленского собора в монастыре была выстроена митрополитом Ионой еще церковь Введения Богоматери, под алтарем которой погребен отец митрополита Ионы Сысой. Монастырь был обнесен оградой с воротами и надвратной церковью Николая Чудотворца 1683 года. В советское время монастырь был закрыт, ограда разрушена (сохранились только ворота), храмы осквернены - в одном из них находился вытрезвитель. Монашеская жизнь вернулась в обитель совсем недавно - в середине 1990-х годов, но восстановление монастыря идет с большим трудом.